"Ayasofya'nın Hazineleri, Ayasofya Haziresi'nde" adlı sergi; Ayasofya Padişah Türbeleri restorasyon çalışmaları kapsamında; Şehzadeler Türbesi'nde insitu durumunda bulunan Ravza-ı Mutahhara örtüleri, Kabe iç örtüleri, Kisve-i Şerif parçaları, sanduka kılıfları, şehzade kaftanları, hanım sultana ait entari gibi ipek, çatma, atlas, kemha türü kıymetli- kutsal eşyalar ile birlikte türbe eşyalarına ait seçme eserlerden oluşan sergi 29.05. 2010 tarihinde Sultan II. Selim Türbesi'nde yapılmıştır.

Mimar Sinan'ı Anma Etkinlikleri Kapsamında Mimar Sinan'ın Eserlerinden oluşan Fotoğraf Sergisi, Ayasofya Müzesi Türbeler avlusunda 09.08.2010 tarihinde gerçekleşmiştir.

18.06 - 12.08.2007 tarihleri arasında UNESCO Mevlana yılı etkinlikleri kapsamında Ayasofya Müzesi'nde farklı müzelerden getirilen eserler ile Mevlana Sergisi düzenlenmiştir.

Asurlular İstanbul'da (Anadolu'nun Önsözü Kültepe Kaniş- Karumu) adlı sergi Ayasofya Müzesine bağlı Aya İrini Anıtı'nda 28 Aralık 2010- 28 Mart 2011 tarihleri arasında gerçekleşmiştir.